Diversos colaboradores do PPGBiotec e de outros Programas de Pós-Graduação da UEFS realizam suas pesquisas no LMM – Laboratório de Modelagem Molecular. Fundado em 2007, o LMM iniciou suas atividades com uma infraestrutura computacional modesta, composta por quatro computadores desktop. Essa configuração inicial permitia a execução de simulações computacionais de baixa complexidade e duração limitada.
Atualmente, o LMM apresenta uma infraestrutura significativamente aprimorada, compreendendo três servidores em rack e sete estações de trabalho de alto desempenho.
Essas estações estão equipadas com os principais softwares empregados em triagens virtuais (virtual screening), que podem ser realizadas tanto por meio de abordagens baseadas em ligantes (ligand-based), em alvos moleculares (structure-based) quanto em inteligência artificial (IA-based drug design).
Essa modernização confere ao LMM a capacidade de conduzir as mais avançadas simulações in silico, abrangendo uma vasta gama de estudos em modelagem molecular.
Curiosidades
O Laboratório de Modelagem Molecular (LMM) desenvolveu o NatProDB, um banco de dados de moléculas originárias de plantas do semiárido baiano.
Atualmente, o NatProDB está hospedado no ZINC database, um dos maiores repositórios virtuais de moléculas, o que confere ao NatProDB ampla visibilidade e acessibilidade internacional.
Paralelamente, o LMM está desenvolvendo uma versão do banco de dados para ser hospedada no domínio da Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS), com o endereço natprodb.uefs.br. Essa iniciativa visa aprimorar a acessibilidade e a integração do NatProDB com a infraestrutura computacional e de pesquisa da instituição.
Objetivo do laboratório/espaço
Fomentar as atividades de pesquisa, ensino, extensão e inovação através de métodos computacionais.
Linhas de pesquisa e projetos
PROJETOS DE PESQUISA
Busca por novos agentes terapêuticos a partir de fontes naturais.
Coordenador: Clayton Queiroz Alves
Caracterização química e avaliação in silico da atividade ansiolítica de passiflora SPP.
Coordenador: Hugo Neves Brandão
Identificação por modelagem molecular e avaliação in vitro de novos atrativos químicos com afinidade ao receptor olfativo de Lutzomya longipalpis, vetor da leishmaniose visceral.
Coordenador: Manoelito Coelho dos Santos Junior
Utilização de ferramentas in silico para a identificação de inibidores de enzimas do Mycobacterium tuberculosis.
Coordenador: Manoelito Coelho dos Santos Junior
Utilização de ferramentas computacionais para identificação de moléculas com interesse biológico.
Coordenador: Manoelito Coelho dos Santos Junior
Identificação de moléculas com efeito carrapaticida oriundas de espécies de Ocotea: isolamento, avaliação in vitro e in silico.
Coordenadora: Mariana Borges Botura
Equipamentos disponíveis
Contatos
- E-mail oficial: lmm@uefs.br
- Website: lmm.uefs.br
- Instagram: https://www.instagram.com/lmmuefs/
- Endereço: Universidade Estadual de Feira de Santana (UEFS). Departamento de Saúde, módulo 6, ME-I sala 61.